Са становишта физиологије, аутогени тренинг омогућава контролу процеса узбуђења и инхибиције, постизања њиховог балансирања. Уз сталну употребу ове технике, способност тела да се брзо прилагођава променљивим условима животне средине повећава се, активирају се ментални процеси, нормализује се деловање нервног система и меморија се побољшава. Од великог значаја је аутогена обука за уклањање синдрома умора, враћање нормалног емоционалног стања организма након преноса стреса, за побољшање памћења и пажње. У терапијске сврхе, ова техника се користи за неурозе и друге функционалне поремећаје, као и за нормализацију рада основних система тела и регулацију метаболичких процеса.
Аутогено обучавање је доступно за проучавање и асимилацију скоро свакоме. Пошто је важност ове психо-хигијенске технике за нормално функционисање тела једноставно непроцењива, а за саму обуку није потребна посебна опрема или симулатори, онда за свакога ко жели да научи методе аутогене обуке, само је неколико минута дневно за такве вежбе. Међутим, чак и тако кратко време ће бити довољно за формирање способности да правилно напне и опусте мишиће, концентришу се на изабрани предмет, регулишу емоционално стање, одржавају нормално функционисање аутономног дела нервног система и тиме надгледају функционално стање унутрашњих органа.
Главни дио аутогеног тренинга је процес аутосугестије, у којем се користе вербалне форме. Фразе треба изговарати у императивном тону од првог јединственог особља, тј. Требало би да почну приближно овако: "Ја сам миран ... осећам се уверен ...", итд. У складу са правилима аутогеног тренинга, у таквим фразама не треба користити честицу "не", односно умјесто израза "нисам болесна", морам рећи "Ја сам здрав", а умјесто "Ја се уопће не забрињавам" боље је рећи "Ја сам апсолутно мирна". И ти изрази се морају изрећи у одређеном редоследу. На почетку вјежбе, фразе треба изговарати да се опусте и опусте, а затим фразе које намерно утичу на тијело и помажу у постизању основних психотерапијских задатака сједнице, а када је вјежба завршена, изрази који се морају опустити и имати мобилизацијски ефекат. Са правилним извршењем технике, особа пада у стање светлости полу-демона, током које се одвија само-хипноза самопомоћи, што помаже у одржавању нормалног функционисања тела.
Утврђено је да код различитих типова емоционалног стања постоји повећана напетост једне или друге групе мишића. На пример, ако је расположење лоше, у мишићима респираторног система постоји повећана тензија, а са страхом повећава се тензија мишића лица. Стога, постижући током аутогеног тренинга опуштања одређене мускулатуре, може се на тај начин осигурати нормално функционисање организма и промјена на боље његово психолошко стање. Дакле, на основу везе између мишићних група и емоционалног стања тела, могуће је значајно смањити неуро-емоционално преоптерећење, смањити замор и тиме промовисати брзу обнављање потребног нивоа ефикасности.
Упркос наизгледној једноставности аутологне обуке и његове огромне позитивне вредности за нормално функционисање тела, и даље постоје неке потешкоће у коришћењу ове технике. На примјер, за дјецу млађу од 12 година, кориштење аутогене обуке често је неефективно, јер у овом добном периоду још увијек није довољно свјестан однос према сопственој личности. Старији људи могу такође имати неке потешкоће у покушају да савладају ову психо-хигијенску технику, јер са узрастом тон трепавих мишића се стално смањује, а контрола релаксације мишића постаје много тежа.